食品安全檢測是按照國家指標來檢測食品中的有害物質，主要是一些有害有毒的指標的檢測，比如重金屬、黃曲霉毒素等。食品科學與工程的一個重要方面是引入和運用化工單元操作，并發展形成食品工程單元操作，從而促進食品工業向大規模、連續化和自動化的方向發展。
色譜技術實質上是一種物理化學分離方法，即當兩相作相對運動時，由于不同的物質在兩相( 固定相和流動相)中具有不同的分配系數(或吸附系數)，通過不斷分配( 即組分在兩相之間進行反復多次的溶解、揮發或吸附、脫附過程) 從而達到各物質被分離的目的。色譜技術已經發展成熟，具有檢測靈敏度高、分離效能高、選擇性高、檢出限低、樣品用量少、方便快捷等優點，已被廣泛應用于食品工業的安全檢測中。色譜中常用的方法有氣相色譜法、高效液相色譜法、薄層色譜法和免疫親和色譜法。
氣相色譜法能夠準確、靈敏地進行快速定性與定量分析，在食品安全檢測中廣泛的應用于天然毒素、農藥、食品添加劑、獸藥等的檢測。薄層色譜法(thin-layer chromatography)是20 世紀30年代發展起來的一種分離和分析方法。儀器操作簡單、方便、應用廣泛，但靈敏度不高。薄層色譜廣泛的應用于農藥、毒素、食品添加劑等方面，在定性、半定量以及定量分析中發揮著重要作用。質譜分析是一種測量離子荷質比的分析法，質譜作為理想的色譜檢測器，不僅特異，而且具有極高的檢測靈敏度。色譜與質譜聯用技術結合了兩者的優點，成為分析化學的研究熱點。其中，氣相色譜-質譜聯用技術(GC-MS)與液相色譜-質譜技術(LC-MS)應用廣泛，前者用于有機物的定性定量分析，后者通常用于極性較大，熱穩定性強、難揮發的樣品分析。
光譜技術光譜分析法是利用物質發射、吸收電磁輻射以及物質與電磁輻射的相互作用而建立起來的一種方法，通過輻射能與物質組成和結構之間的內在聯系及表現形式，以光譜測量為基礎形成的方法。光譜分析是一種無損的快速檢測技術，分析成本低。其中，拉曼光譜、紅外光譜、近紅外光譜以及熒光光譜等在食品安全檢測中應用較為廣泛。
近紅外光是指波長介于可見區與中紅外區之的電磁波，波數范圍為12500～4000cm。近紅外光譜(NIR)分析技術是一種間接的分析技術，通過建立校正模型對樣品進行定性或者定量分析。近紅外光譜技術具有速度快、無需制備樣品以及成本低等優勢，已經廣泛應用于食品安全分析方面。拉曼光譜(raman spectroscopy)技術是一門基于鍵的延伸和彎曲的振動模式，利用散射光的強度與拉曼位移作圖獲取信息。在食品安全檢測分析中，可以定性分析待測物質，也可以定量檢測食品成分中含量的多少。高光譜圖像技術(hyperspectral imaging)是20 世紀80年代發展起來的新技術，集圖像信息與光譜信息于一身，在農畜產品、食品的品質與安全性檢測中有著廣泛的應用。
生物技術生物檢測技術是近年來飛速發展，且在食品檢測中備受關注。由于食品多數來源于動植物等自然界生物，因此自身天然存在辨別物質和反應能力。利用生物材料與食品中化學物質反映，從而達到檢測目的的生物技術在食品檢驗中顯示出巨大的應用潛力，具有特異性生物識別功能、選擇性高、結果精確、靈敏、專一、微量和快速等優點。應用較廣泛的方法有酶聯免疫吸附技術、PCR 技術、生物傳感器技術以及生物芯片技術等。
酶聯免疫吸附技術(enzyme-linked immu-nosorbent assay，ELISA)是建立在免疫酶學基礎上，將抗原抗體反應的高度特異性和酶的高效催化作用相結合而發展建立的一種免疫分析方法。基本原理是利用酶標記的抗原或酶標記的抗體作為主要試劑，通過復合物中的酶催化底物呈色反應來對待測物質進行定性或定量，在農藥和獸藥殘留、違法添加物質、生物毒素、病原微生物、轉基因食品等食品安全檢測方面廣泛應用，如恩諾沙星、瘦肉精以及嗜堿耐鹽性奇異變形桿菌等的測定。PCR(polymerase chain reaction)技術，即聚合酶鏈式反應技術，是一種體外酶促合成，擴增特定的DN段的方法，是調查食品源疾病爆發及鑒定響應病原菌的有用工具，以其特異性強、靈敏度高以及準確快速等優點在食品檢測領域廣泛應用。
生物傳感器是一種將生物識別元素與目標物質結合的物理傳感器，具有高特異性和靈敏度、反應速度快、成本低等優點，已經成為食品檢測中的重要工具。主要應用于食品添加劑、致病菌、農藥和抗生素、生物毒素等方面的檢測。如食品中亞硝酸鹽、鼠傷寒沙門菌、有機磷酸酯和氨基甲酸鹽、黃曲霉素B1等的快速測定。生物芯片法是一項綜合分子生物技術、微加工技術、免疫學、計算機等技術的全新微量分析技術，將分析過程集成在芯片上完成，實現樣品檢測的連續化、集成化、微型化和信息化。在食品安全檢測中可應用于食源性微生物、病毒、藥物、真菌毒素以及轉基因食品等的檢測分析。
快速檢測食品安全的隱患和食品安全問題日趨嚴重，隨著《中華人民共和國食品安全法》頒布實施，人們對食品安全的重視和關注程度也不斷增強，食品安全監管隨之成為新的關注焦點。國內發生了很多食品安全事件，如2010年青島毒韭菜事件、2011年瘦肉精事件等等，這些食品安全問題都直接威脅著人們身體健康和生命安全。《中華人民共和國食品安全法》中明確提出食品安全監管應實現從農田到餐桌全程監管，這為監管成為政府執法部門提出一大難題。國內食品安全監管部門逐步調整監管模式，由以往由部門監督向技術監管轉變。技術監管中檢測的準確性、檢測速度的快慢等問題是急需解決的問題。食品快速檢測技術是技術監管的前體，作為保障食品安全的主要手段，越來越引起各監管部門的重視。由于食品原料大量使用農藥、激素、抗生素以及加工過程中非法添加的有毒有害物質，食品中毒事件頻發，且突發性強，蔓延快，傳統的檢測手段已經無法滿足監督快速和預警需要。食品快速檢測技術是相對傳統檢驗檢測而言的。用快速檢測技術方法在現場對樣品進行篩查，其特點是相對危害指標進行定性檢測，檢測速度快，能贏得時間，可消除食品安全隱患。產品實驗室檢測結果雖然準確、可靠，但周期長、費用高、操作繁瑣。
